OHDSI ATLAS 구동하기
OHDSI 공식 홈페이지 에서 Software Tools 메뉴 를 찾아보면 ATLAS 를 가장 먼저 소개하는데 CDM 데이터베이스를 구축하였으니 이제 ATLAS 를 구동해보려고 한다 실제로도 ATLAS 는 OHDSI 프로젝트의 중추라 볼 수...
#develop, #ohdsi, #healthcare, #open-source, #data공개데이터로 CDM 데이터 구축해보기
해당 포스트는 2020년 공개SW개발자센터 글로벌 전문 개발자 지원사업 의 일부로 작성하였습니다. 이번 포스트에서는 앞 포스트 에서 언급하였던 OMOP-CDM 데이터를 직접 구축해보자. 우선 데이터모델의 공개 Repository 에 접속해보자. 확인해보면 각 Database...
#data, #healthcare, #open-sourceOHDSI 프로젝트와 공개SW개발자센터 활동 시작
해당 포스트는 2020년 공개SW개발자센터 글로벌 전문 개발자 지원사업 의 일부로 작성하였습니다. 지난 2월부터 정보통신산업진흥원 내 공개SW개발자센터 의 지원사업 중 글로벌 전문 개발자 프로그램에 지원하여 선정이 되었다. 간략하게 정리하면 국내외 공개SW...
#data, #healthcare, #open-sourceYona-Jenkins 연동방법
회사에서 이슈 트래커 + 코드 저장소로 Yona 를 사용하고 있고, 필요에 의해서 하나씩 고쳐쓰다보니 committer 로 활동하고 있다. 이번 포스팅은 Yona 와 CI 툴인 Jenkins 와 연동하는 기본 방식을 설명한다....
#develop, #yona, #jenkins, #ciUbuntu 에서 MySQL-python 설치시 오류 해결
Python 에서 SQLAlchemy 를 사용하여 MariaDB (혹은 MySQL) 을 사용할 때 아래와 같은 메세지가 발생했다. ImportError: No module named MySQLdb MySQL-python 을 pip 로 설치 시도. $ sudo pip install...
#python, #ubuntu, #mysql