OHDSI 프로젝트와 공개SW개발자센터 활동 시작

해당 포스트는 2020년 공개SW개발자센터 글로벌 전문 개발자 지원사업 의 일부로 작성하였습니다.

지난 2월부터 정보통신산업진흥원 내 공개SW개발자센터 의 지원사업 중 글로벌 전문 개발자 프로그램에 지원하여 선정이 되었다.

간략하게 정리하면 국내외 공개SW 프로젝트를 지정한 후 개발에 참여하는 것을 지원하는 사업이라 보면 된다.

요즘 의료데이터 분석을 업으로 하고 있어서 자주 접하고는 있으나 참여에 엄두를 내지 못하던 Observational Health Data Sciences and Informatics (OHDSI) 에 좀 더 시간을 내어 참여하고자 지원을 하였다.

기존에 병원에 누적되는 데이터를 Electronic Medical Record (EMR) 혹은 Electronic Health Record (EHR) 이라고 하는데, 해당 데이터가 공통된 데이터 형식을 따르지 않아 관련한 연구에 많은 어려움이 있는 상태이다.

OHDSI 컨소시엄은 OMOP-CDM 기반의 분산연구망을 이끌고 나가는 국제적인 비영리 연합체로 공통된 데이터 (CDM) 기반의 오픈소스를 운영하고 있다. (CDM 과 관련된 내용은 신수용 교수님 의 블로그에 좋은 내용이 소개 되고 있으니 관심이 있다면 찾아가보자.)

전에 직접 관련 소스들을 세팅하면서 꽤 많은 문제를 겪어서 (이미 Pull Request 도 날렸었다.) 추후 작업하는 분들은 같은 문제에 고통 받지 않도록 도움이 될까하여 활동을 하며 관련 기록들을 블로그에 정리할 예정이다.